Moderadores
Introducción a metodologías de simulación de biomoléculas: Minicurso
- José Colbes (Facultad Politécnica - UNA)
- Santiago Di Lella (Facultad de Ciencias Exactas y Naturales –Universidad de Buenos Aires)
Introducción a metodologías de simulación de biomoléculas: Minicurso
- Santiago Di Lella (Facultad de Ciencias Exactas y Naturales –Universidad de Buenos Aires)
- José Colbes (Facultad Politécnica - UNA)
Descripción
Este minicurso intensivo de tres horas introduce los fundamentos y aplicaciones de la simulación computacional de biomoléculas en el contexto de la biología matemática contemporánea. Se abordarán los principios físicos y químicos que gobiernan la estructura, dinámica e interacción de proteínas, ácidos nucleicos y membranas biológicas; se presentarán los métodos de modelado molecular y simulación atomística más utilizados, incluyendo dinámica molecular y docking molecular. El curso destacará la integración entre modelos matemáticos, biofísica computacional y datos experimentales. Se discutirán estrategias para la construcción de modelos estructurales y la preparación de sistemas biomoleculares complejos. Se explicarán los fundamentos estadísticos y termodinámicos que permiten interpretar trayectorias de simulación. Se introducirán conceptos de paisaje energético, estabilidad conformacional y reconocimiento molecular. Se analizará el papel del microentorno y de la heterogeneidad molecular en la modulación de interacciones biomoleculares. Se mostrarán ejemplos de aplicación en biomedicina, biotecnología y desarrollo de fármacos. Se revisarán casos de estudio donde la simulación computacional permitió comprender mecanismos moleculares relevantes. Se discutirán herramientas de software ampliamente utilizadas y flujos de trabajo reproducibles.
El curso incluirá recomendaciones para el diseño de proyectos interdisciplinarios en biología matemática. Se presentarán enfoques multiescala que conectan modelos atomísticos con descripciones mesoscópicas y macroscópicas. Se explorará la relación entre simulación, predicción y validación experimental. Se enfatizará la interpretación crítica de resultados computacionales. Se discutirán limitaciones metodológicas y desafíos actuales del campo. Se promoverá la interacción con la audiencia mediante preguntas y discusión de aplicaciones específicas.